Gene search
Sequence information
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Vvi16g362 | ATGGGGCTTGATTGGCAGCAAATCATTAAAGAGGGTCCATTATTTTTCCTTCATTCCTTTGAAAACCGGCAGATTGTGATTTTGAGAATCTTGGATGGCATATCAGTAACTTCCTCGTATTCCAGTACACGACTCGACACCATCGGGAATTCCCATATGATGGAAGATGACAAGAAGCTCAAGCTAATTCTAACACTGTGCTCGGCAGCATTTCTAGCGACTGTGTTGTGTTTCATCTACTTGTGTTGTAAACAAAGAAGGCAGAATGAAGATGATGAGAAAGCAAGCTTGGAGTTGAAGGAAAGTGATGAAGAAAATAAAGAAAATTTGGTAACTTTTGAAGGTGGCCAAGATCTTACTATATATGATATATTGGACGCGCCTGGTGAAGTGATTGGGAAGTCAAATTACGGAACTTTGTACAAGGCTAGTTTTACGGGAAGGAGGGCGGGGTCACTGAGGCTGCTTCGGTTTCTGAGGCCTGCTTGCAGCGGAAGAATGGAGGAAGTTGTTGGTGTGATTCATATGCTGGGGTGTATAAGGCATAATCGCTTGGTTCCACTTGAAGCGTTTTACGCAGGGCCTAAAGGTGAGAAGCTTCTTGTTCATCCATTTTACGGATATGGGAATCTGGCGCGCTTCATCAGAGATGGAAATGGAGAGTCTCACAAATGGGCAGTCATCTATAGAATATCTGTTGGTATTGCTCAAGGATTGGATCATCTCCACACAGGATTGCAGAAGCCTGTAATCCATGGAAATCTCAAGTCCAAGAACATACTTCTGGATCGAAATTTCCAACCTTACATCTCGGATTTTGGGCAACACCTCCTCTTGAATCCAAGTGCAGGACAAGAAATGCTTGAAAGTTGTGGAGCTCAGGGATACAGGGCTCCTGAGCTCATCAAAATGAAGGATGTATGCCAAGAGACTGATATCTACAGCCTTGGGGTAATATTACTTGAATTACTTACAGGGAGGGAACCCATCAATGAGAACCCATCAGCTGATGAGGATTTTTACTTGCCTAACTCAATCAGAAATTGGTTAATGAACAAACACAGAAAGATAATATATATATCAAGGAACAGAGTAAATCAATCACATATAGCTAATGAATCAATCAATCAGTCAATCAATCATGAAGTCCCATATGTAGGGGCCCCCACCAAAGCCCATTTATTTTGCATGTATCAAATCTGTAAATTCCATCACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN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NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGGGTGCGCATCTATTCATATTTCGCCAATTCTTTATACATGCTTTACTTCTCATATTGTGCATGATCGATTTGGCCCTGTATCTGAAGAATGCGTTCTCAAATTGTTTCAGCTTGCCATGGCTTGTTGTTCTCCCTCACCAACTCTTAGACCCAACATCAAGCAAATTCTCAGGAAGATGGAAGAAATTGGAAAATAA | 31131 | 1.89 | 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XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXGCASIHISPILYTCFTSHIVHDRFGPVSEECVLKLFQLAMACCSPSPTLRPNIKQILRKMEEIGK* | 10377 |
Gff information
| Chromosome | Start | End | Strand | Old_gene | Gene | Num |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 9126427 | 9159944 | + | Vvi16g362 | Vvi16g362 | 778011 |
Annotation information
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Vvi16g362 | 10376 | Coils | Coil | 87 | 107 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | SUPERFAMILY | Protein kinase-like (PK-like) | 129 | 346 | IPR011009 | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | Coils | Coil | 10376 | 10376 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | PANTHER | PROTEIN KINASE SUPERFAMILY PROTEIN | 54 | 375 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | PANTHER | PROTEIN KINASE SUPERFAMILY PROTEIN | 10326 | 10375 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | ProSiteProfiles | Protein kinase domain profile. | 126 | 10374 | IPR000719 | GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468 | |
| Vvi16g362 | 10376 | PANTHER | LEUCINE-RICH REPEAT RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE IMK3-RELATED | 54 | 375 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | PANTHER | LEUCINE-RICH REPEAT RECEPTOR-LIKE PROTEIN KINASE IMK3-RELATED | 10326 | 10375 | - | - | |
| Vvi16g362 | 10376 | Pfam | Protein kinase domain | 168 | 335 | IPR000719 | GO:0004672|GO:0005524|GO:0006468 | |
| Vvi16g362 | 10376 | Gene3D | Transferase(Phosphotransferase) domain 1 | 123 | 382 | - | - |
Transcription factors information
| Select | Gene | Hmm_acc | Hmm_name | Score | E-value | Regulatory Factors | Family |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 76267 | PF00069 | Pkinase | 1.30E-23 | CL0016 | Vvi | PK |
Pathway information
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Vvi16g362 | - | - | vvi:100244014 | 603.594 |