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Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi1g84 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7825
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
1 806982 839693 + Vvi1g84 Vvi1g84 769284
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi1g84 7824 CDD RX-CC_like 12 118 IPR038005 -
Vvi1g84 7824 PANTHER DISEASE RESISTANCE PROTEIN RP 980 1788 IPR044974 GO:0006952
Vvi1g84 7824 PANTHER DISEASE RESISTANCE PROTEIN RP 32 838 IPR044974 GO:0006952
Vvi1g84 7824 Gene3D - 1347 1436 IPR036388 -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 397 486 IPR036388 -
Vvi1g84 7824 Coils Coil 32 59 - -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 310 396 IPR042197 -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 1260 1346 IPR042197 -
Vvi1g84 7824 SUPERFAMILY L domain-like 1426 1788 - -
Vvi1g84 7824 PRINTS Disease resistance protein signature 1127 1142 - -
Vvi1g84 7824 PRINTS Disease resistance protein signature 1199 1213 - -
Vvi1g84 7824 PRINTS Disease resistance protein signature 1295 1309 - -
Vvi1g84 7824 PRINTS Disease resistance protein signature 1723 1739 - -
Vvi1g84 7824 SUPERFAMILY P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 1096 1360 IPR027417 -
Vvi1g84 7824 SUPERFAMILY P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 150 410 IPR027417 -
Vvi1g84 7824 Coils Coil 988 1008 - -
Vvi1g84 7824 SMART AAA_5 1124 1259 IPR003593 -
Vvi1g84 7824 SMART AAA_5 175 309 IPR003593 -
Vvi1g84 7824 Pfam Rx N-terminal domain 962 1041 IPR041118 -
Vvi1g84 7824 Pfam Rx N-terminal domain 13 92 IPR041118 -
Vvi1g84 7824 Coils Coil 104 124 - -
Vvi1g84 7824 PANTHER - 980 1788 - -
Vvi1g84 7824 PANTHER - 32 838 - -
Vvi1g84 7824 CDD RX-CC_like 961 1060 IPR038005 -
Vvi1g84 7824 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 1491 1789 IPR032675 -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 12 125 - -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 961 1072 - -
Vvi1g84 7824 SMART LRR_typ_2 590 613 IPR003591 -
Vvi1g84 7824 SMART LRR_typ_2 567 589 IPR003591 -
Vvi1g84 7824 SMART LRR_typ_2 1517 1539 IPR003591 -
Vvi1g84 7824 SMART LRR_typ_2 1540 1563 IPR003591 -
Vvi1g84 7824 Pfam NB-ARC domain 161 398 IPR002182 GO:0043531
Vvi1g84 7824 Pfam NB-ARC domain 1110 1349 IPR002182 GO:0043531
Vvi1g84 7824 SUPERFAMILY L domain-like 476 836 - -
Vvi1g84 7824 Coils Coil 1847 1847 - -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 1097 1254 IPR027417 -
Vvi1g84 7824 Gene3D - 145 304 IPR027417 -
Vvi1g84 7824 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 505 847 IPR032675 -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi1g84 K13457 - vvi:100252530 1651.34