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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Vvi9g802 ATGTCTCGCCCACCTGCTGCTCGCCTCTTGCTCTTCATCTTTTCCTTTTGGTTTGGTGCTTCTTTCATTCAGATCTGTTGTGCACAAAGCGTGGTGGTTGATCCAAAGTTGAAGTTTGAGAATCCAAGACTTCGGCAAGCCTACATTGCCCTCCAAGCATGGAAGACGGCCATTTTCTCAGACCCCTTCAACTTCACCTCCAACTGGGTTGGTCCTCAACTGGGCCTCCTCTCCGACTTGGCTCTCTTCCATCTCAACTCCAACCGCTTCTGCGGCATTGTTCCCAGCTCTTTGAAGCGCATGAAGCTCCTCTACGAGCTGGACATCAGTAACAACCGCTTCGTGGGGAGCTTCCCCAATGTGGTGTTGTCCATGCCCTCCCTCAAGTTCCTGGATCTCCGATTCAATGAGTTCGAGGGTCCAGTTCCATCCCAGCTCTTCAATAAGGATCTGGATGCAGTTTTCCTCAATGACAACAGATTCCAATTCGGCATCCCTCAGAATCTGGGCAATTCACCCGTCTCTGTTCTGGTCTTGGCCAACAACAATCTTGGGGGTTGCATTCCAGGCAGCATTGGTAAGATGGGAAAAACCCTAAATGAGATCATCCTCATGAACGACAATCTCACTTCATGCTTACCTCCTCAAATCGGCCTTCTCAAAGAGGTTACCGTGTTTGATGTGAGCTTCAATCATCTCCAAGGCTCACTGCCACCCGCCATTGGCAAGATGAAGAGCTTGGAGCAGCTGGATGTTGCCCACAACAGTTTCACCGGTGCGATTCCGCCCAGCATCTGTCAGCTGCCCAGATTGGAAAACTTCACCTATTCTTTCAACTATTTCACCGGAGAGGCTCCTGTTTGTGCTGCCATTACTGGTGATGGTCGCCAGAATTGTATCCCAGGAAAGACGGACCAGCGGTCCTCTAGTATGTGTTCCTCTCAAGCTGCACGTCCTGTGGATTGCAGCAAGTCCAAATGCGGCGGCGGCAGCACCAACGCTGGTGATCACACCCACCACCACCCCAATCACAACACTCGTCCGTGCCTCCTCCCGCCAAATCATATCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNACCACCTCCATCATCGAATCATTACCATTATTCATCACCACCACCGCCATTATCCACAACAGGACATTACAGTTCGCCACCTCCGTCATCAAACCACTATCATTATTCACCACCACCACCACCACCACAATCATCGAGCCATTATACTTCCCCACCTCCCCCACCCACCGAAAAAGGATCACCAAATGCCCATTTTGTACCACCACCGCCACCACCTGTCTATCCACATATGACACCGCCATCCCCACCCCCGCCCTCACCTTCATCACCAAATCCGCCCCCAGAGTCTGAGATGCCTCCGTCACATCAACAACAGCCTCCATCACCTGGGCCTTTGCATCCTCTTCCTCCTTCACCACCATCTGGATGTGGCACTCCTGGATCCCTACTCCCACCACCACCACCGCCACATTCTCTACCAGTACCATTGGCACCAGCACCCAGCCATCACCACTCACAATCATACCCACCTCCCTCACAACATTGGCATCATCCACCACCGTTACACCATCAAAATTCTCCACCACCCACCAAAAACCCATATTCACCCCCTCCACCGCCTCCGGATAACGTGCCATTGCCACCAGTTATCGGGCTTCACCTTTCTGCTTCTTGTTATTTATGTATTCTTATTAATTTATATGATGAAGAAAATGATACAGACATGGGTTTTGGAAGAGGGGCATGA 3195 28.2 MSRPPAARLLLFIFSFWFGASFIQICCAQSVVVDPKLKFENPRLRQAYIALQAWKTAIFSDPFNFTSNWVGPQLGLLSDLALFHLNSNRFCGIVPSSLKRMKLLYELDISNNRFVGSFPNVVLSMPSLKFLDLRFNEFEGPVPSQLFNKDLDAVFLNDNRFQFGIPQNLGNSPVSVLVLANNNLGGCIPGSIGKMGKTLNEIILMNDNLTSCLPPQIGLLKEVTVFDVSFNHLQGSLPPAIGKMKSLEQLDVAHNSFTGAIPPSICQLPRLENFTYSFNYFTGEAPVCAAITGDGRQNCIPGKTDQRSSSMCSSQAARPVDCSKSKCGGGSTNAGDHTHHHPNHNTRPCLLPPNHIXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPPPSSNHYHYSSPPPPLSTTGHYSSPPPSSNHYHYSPPPPPPQSSSHYTSPPPPPTEKGSPNAHFVPPPPPPVYPHMTPPSPPPPSPSSPNPPPESEMPPSHQQQPPSPGPLHPLPPSPPSGCGTPGSLLPPPPPPHSLPVPLAPAPSHHHSQSYPPPSQHWHHPPPLHHQNSPPPTKNPYSPPPPPPDNVPLPPVIGLHLSASCYLCILINLYDEENDTDMGFGRGA* 1065
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
9 13695702 13699381 + Vvi9g802 Vvi9g802 792513
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Vvi9g802 1064 Coils Coil 356 356 - -
Vvi9g802 1064 MobiDBLite consensus disorder prediction 847 866 - -
Vvi9g802 1064 Gene3D Ribonuclease Inhibitor 60 293 IPR032675 -
Vvi9g802 1064 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED 73 1036 - -
Vvi9g802 1064 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 3-RELATED 11 74 - -
Vvi9g802 1064 SUPERFAMILY L domain-like 64 286 - -
Vvi9g802 1064 MobiDBLite consensus disorder prediction 328 352 - -
Vvi9g802 1064 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 2 11 74 - -
Vvi9g802 1064 PANTHER LEUCINE-RICH REPEAT EXTENSIN-LIKE PROTEIN 2 73 1036 - -
Vvi9g802 1064 MobiDBLite consensus disorder prediction 867 979 - -
Vvi9g802 1064 MobiDBLite consensus disorder prediction 817 1031 - -
Vvi9g802 1064 MobiDBLite consensus disorder prediction 995 1030 - -
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Vvi9g802 - - vvi:100265463 659.062