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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Csa05g01698 ATGGCGGCCAACCCCAACTCCGTTTCCTTCAGGGTTCCCTACAGGAACCTCCATGATGCAGAAGTGGAGATGGTGGCTGTCGATGAACACCAGCTTCACGGGATCGATCTCAATTCTCCTTCTTCTGATGGATGTCCCAATGGAAGCCAACCTGAACACAGTTTTCCCTCTTCGCCCCATATTAGATCTAAGCCCAGTAGTTTGATTATCTTAATTCTCAGTTGTACTATCGCTGCCGGTGTTCAATTTGGTTGGGCATTACAGCTTTCCCTTCTAACTCCCTATATTCAGACGCTCGGAATTGAGCATGCATTTTCTTCCTTTATTTGGCTATGTGGTCCCATCACTGGGCTCGTGGTTCAACCATGTGTCGGTATATGGAGTGATAAGTGTTCTTCAAAATATGGAAGGAGGCGTCCCTTCATTCTTGCTGGGTCCTTAATGATAGCAGTTGCTGTGGTGTTGATTGGATTTTCTGCTGACATTGGATATATATTAGGAGATACAAAGGAGCATTGCAGAGTATATAAGGGTACACGAACAAGGGCAGCTATTATCTTTGTAATAGGGTTTTGGATGCTTGATCTTGCAAACAATACGGTGCAGGGTCCTGCTCGTGCTCTTCTAGCTGATTTATCAGGTCCTGATCAGCACAATGTTGCAAATGCGGTATTTTGTTCATGGATGGCTGTTGGTAATATTCTAGGTTTTTCAGCAGGAGCTAGTGGAAACTGGCACAAATGGTTTCCTTTTCTCTTAAGTAATGCTTGCTGCGAAGCCTGTGGAAACCTTAAAGCTGCATTTCTTATTGCTGTGCTTTTTCTAACCATATGTACTCTTGTTACAATATATTTTGCCGATGAAGTTCCACTTACTGCTGTAGATCAACCACCACGCTTATCAGATTCTGCTCCCCTGTTGAATGGGAGTGAACAAAATAGTCCTGATATTTTAAAACCAGAACTTAATGGTTTGAATGGGAGCAGCGTTGACTATGGCCATCATGAAAATATTAATTTGAAAAATTCGAAAGCAGAAAGTGAGGAAAATCAAAGCGAAGGTTATTATGATGGTCCTGCAACAGTAATAGTTAAATTGTTGACTAGTTTAAGACATTTACCACCTGCCATGCATTCAGTGCTTCTTGTGATGGCTCTTAGCTGGTTATCTTGGTTTCCCTTCTTCTTATTTGACACGGATTGGATGGGAAGGGAAGTGTATCATGGGGACCCAAAGGGCAGTTTGACTGACGAACGGGTTTATGATCAGGGTGTCAGAGAAGGTGCATTTGGTTTGCTATTGAATTCTGTTGTTCTTGGTATCAGTTCTTTCTTTATAGAGCCCATGTGTCAGCGCATGGGAGCCAGGGTTGTCTGGGCAATGAGCAACTTTATTGTGTTTGCATGCATGACGGGAACTACTATTATTAGTTTAATATCCGTCAGTCATTACTCTGAAGGAATTGAACATATTATTGGGGGAAACTCAACAATAAAAAATGCTGCCTTGGCTGTTTTTGCACTTCTTGGTTTTCCTCTTGCCATAACATATAGTGTACCCTTCTCTTTGACGGCAGAATTGACTGCCGATTCTGGTGGTGGCCAAGGATTGGCTATAGGAGTTCTCAATCTTGCTGTTGTTATTCCCCAGATGATTGTATCCCTGGGAGCTGGGCCATGGGATGCATTATTCAGTGGAGGAAACATTCCTGCATTTGCTTTGGCCTCTATATGTGCTCTTGCGGCTGGAGTCGTTGCAGTTCTTAGATTGCCTAATCAAATAAGCAGTTCTTTCAAATCCACGGGTTTTCATTTTGGTTAG 1821 42.83 MAANPNSVSFRVPYRNLHDAEVEMVAVDEHQLHGIDLNSPSSDGCPNGSQPEHSFPSSPHIRSKPSSLIILILSCTIAAGVQFGWALQLSLLTPYIQTLGIEHAFSSFIWLCGPITGLVVQPCVGIWSDKCSSKYGRRRPFILAGSLMIAVAVVLIGFSADIGYILGDTKEHCRVYKGTRTRAAIIFVIGFWMLDLANNTVQGPARALLADLSGPDQHNVANAVFCSWMAVGNILGFSAGASGNWHKWFPFLLSNACCEACGNLKAAFLIAVLFLTICTLVTIYFADEVPLTAVDQPPRLSDSAPLLNGSEQNSPDILKPELNGLNGSSVDYGHHENINLKNSKAESEENQSEGYYDGPATVIVKLLTSLRHLPPAMHSVLLVMALSWLSWFPFFLFDTDWMGREVYHGDPKGSLTDERVYDQGVREGAFGLLLNSVVLGISSFFIEPMCQRMGARVVWAMSNFIVFACMTGTTIISLISVSHYSEGIEHIIGGNSTIKNAALAVFALLGFPLAITYSVPFSLTAELTADSGGGQGLAIGVLNLAVVIPQMIVSLGAGPWDALFSGGNIPAFALASICALAAGVVAVLRLPNQISSSFKSTGFHFG* 607
       

Gff information

Chromosome Start End Strand Old_gene Gene Num
5 20184545 20190732 - CsaV3_5G025170.1 Csa05g01698 530085
       

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Csa05g01698 606 SUPERFAMILY MFS general substrate transporter 53 591 IPR036259 -
Csa05g01698 606 PANTHER SUGAR TRANSPORTER 51 606 - -
Csa05g01698 606 MobiDBLite consensus disorder prediction 38 60 - -
Csa05g01698 606 CDD MFS_SLC45_SUC 71 588 - -
Csa05g01698 606 Pfam MFS/sugar transport protein 85 286 - -
Csa05g01698 606 Gene3D MFS general substrate transporter like domains 64 590 IPR036259 -
Csa05g01698 606 PANTHER SUCROSE TRANSPORT PROTEIN SUC3 51 606 - -
       

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
Csa02g00856 Csa-Chr2:7878961 Csa05g01698 Csa-Chr5:20184545 2.02E-40 dispersed
Csa02g02236 Csa-Chr2:20093960 Csa05g01698 Csa-Chr5:20184545 7.83E-153 dispersed
       

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Csa05g01698 K15378 - csv:101205348 1189.48